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當神經退化疾病進行時，為了清除凋亡中的神經細胞，發炎反應也會被活化。過多的發炎反應有可能將殘存的神經細胞也一併清除，進而導致〝神經細胞死亡〞與〝發炎反應〞之間的惡性循環。20世紀科學家對於巴金森氏症患者進行解剖，都能發現中腦灰質部均有小膠質活化的現象。如果患者合併失智症，則在海馬迴也有相同現象。這種發炎現象可以應用在未來巴金森氏症，透過疫苗的開發，可利用神經系統發炎反應，來清除阿發突觸蛋白沉積的神經元，延緩巴金森氏症病情之惡化。
目前已有一家公司針對巴金森氏症的疫苗（AFFITOPE PD01）進行人體試驗，該疫苗可啟動身體的免疫細胞，來清除阿發突觸蛋白預計三年內可上市。
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